控制系統是攪拌站的中樞，污水潛水攪拌機采用計算機控制，既可自動控制，也能手動操作，操作簡單，易于掌握，動態面板顯示，能清楚了解各部件的運行情況。采用四個泵芯分別向四個軸頭供油，不需使用分流閥，避免了分流閥的堵塞，能保證將黃油供到軸頭，減少維修和保養的工作量。導軌體系可自在調整拌和器的提高和降低，并無需排空水池情況下拆卸和設備拌和器，拌和器悉數的分量受力在一個支架上，而且這個支架可接受拌和器發生的推力。拌和器的電機殼體由優異不銹鋼制作，殼體厚度足以接受何載，其外表加工平整潤滑。

    電機配有操控和動力水下電纜，為了感動大極限地維護電機，即使在偶爾的不正常運轉情況下，電纜損壞且電機仍在水下，電纜進口也不允許有濕氣進入電機和接線盒，電纜進口宜選用三道密封，內側選用單芯電纜剝皮并鍍錫后嵌入樹脂中，中心整個電纜嵌入樹脂中，外部用長橡膠環密封，電纜密封組件應做成一集成。機旁操控箱用于操控潛水拌和機的開/停，動力及信號電纜的轉接，操控箱內包含動力及信號接線轉接端子排，潛水拌和機毛病信號變換設備，帶手動復位功用，發動及中止按鈕，信號燈等元件。